Giovagnoli ha prodotto le seguenti pubblicazioni:
– I precursori della società nuova, commemorazione dei coniugi Leopoldo e Alice Franchetti…, "Leonardo da Vinci", Città di Castello 1920;
– Città di Castello, “Il Solco”, Città di Castello 1921;
– Le origini della pittura umbra: gli affreschi recentemente scoperti nell’alta Umbria, Città di Castello 1922;
– Il Palazzo Vecchio Bufalini e la storia del Circolo Tifernate, Ricordo offerto ai soci del Circolo Tifernate nel Cinquantesimo dalla fondazione, 9 febbraio 1873 – 9 febbraio 1923, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello, 1923;
– La prima giovinezza di Raffaello, con cinque riproduzioni di affreschi signorelliani inediti e un’acquaforte originale di G. Celestini, [con G. Magherini Graziani], “Il Solco”, Città di Castello 1927;
– Conferenze alla Montesca. Anno 1926. L’arte italiana nel periodo francescano. Le cattedrali medioevali, la pittura, “Pliniana”, Selci Umbro 1926;
– Nella solenne inaugurazione della nuova sede della Biblioteca Comunale, Il Palazzo Vitelli alla Cannoniera, "Leonardo da Vinci", Città di Castello 1926;
– Da Parini a Pascoli: saggio di una spiegazione cristiana della vita letteraria italiana dalla rivoluzione francese ai giorni nostri, Città di Castello 1931;
– Gubbio nella storia e nell’arte, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1932;
– Conferenze alla Montesca. Anno 1932. In memoria dei Baroni Franchetti, con testi anche di Teresa Belforti, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1932;
– Conferenze alla Montesca. Anno 1933. Dante poeta della filosofia cristiana. Wagner e la musica italiana. Il problema filosofico della letteratura drammatica contemporanea, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1933;
– In memoria di Damiano e Tito Vezio Pistolesi, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1933;
– Conferenze alla Montesca. Anno 1935. La città di Santa Caterina, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1935;
– Tramonti e albe di religioni nell’impero di Augusto, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1938;
– Una famiglia italiana nella Spagna durante la dominazione bolscevica, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1939;
– Relazione sulle scuole medie private di Città di Castello per la associazione delle medesime all’E.N.I.M. dall’inizio all’anno 1939-40, Città di Castello 1940;
– Per i nostri caduti in Spagna, "Leonardo da Vinci", Città di Castello 1940;
– Il tesoro eucaristico di Canoscio. La pittura umbra nelle sue origini. Due cimeli del secolo XI. Ultime scoperte a Città di Castello, Ricerche di Storia e di Arte Cristiana Umbra, “Leonardo da Vinci”, Città di Castello 1940;
– Sulle orme di S. Francesco, conferenze alla Montesca stampate per opera dell’Opera Pia Regina Margherita, "Leonardo da Vinci", Città di Castello 1940;
– Città di Castello e l’arte della stampa, Scuola Tecnica Industriale Statale per le Arti Grafiche, Città di Castello 1943.
– Il dramma della Rinascenza nella storia della famiglia Vitelli, "Leonardo da Vinci", Città di Castello 1943;
– Vita di Beata Margherita da Città di Castello Terziaria Domenicana, Città di Castello 1944.
